À l'UCO, la réforme LMD est mise en place depuis septembre 2004.
4 domaines de formation ont été définis : Théologie et sciences religieuses / Culture et langues / Sciences humaines, sociales et gestion / Sciences et technologies.
Connaissance académique : les formations conçues par les équipes pédagogiques de l'UCO permettent la maîtrise d'une ou deux disciplines et offrent à chaque étudiant une orientation progressive, en fonction de son projet personnel et professionnel.

Professionnalisation : depuis plus de 30 ans, L'UCO développe une dimension professionnelle dans tous ses cursus de formation pour préparer à l'insertion professionnelle.

Ouverture culturelle : des modules transversaux sont proposés à tous les étudiants, dans les domaines suivants : arts, culture, vie associative, philosophie, fait religieux etc.

 LICENCE
Après le baccalauréat, l'étudiant peut s'inscrire dans un parcours de formation qui le conduit à la licence. La licence se déroule sur 6 semestres (3 années de 2 semestres chacune) et correspond à l'obtention de 180 crédits. Les étudiants titulaires d'un DUT, d'un BTS ou issus d'une classe préparatoire peuvent rejoindre le parcours de licence, sous réserve de la reconnaissance totale ou partielle de leurs parcours par l'université (validation des acquis - validation d'études).

 MASTER
Après la licence, le master est organisé en 4 semestres (2 années de 2 semestres chacune) et correspond à l'obtention de 120 crédits. Il offre deux orientations : professionnelle ou recherche. Les titulaires d'un master recherche ont vocation à poursuivre en doctorat (préparation d'une thèse).

 DOCTORAT
C'est un diplôme qui sanctionne un travail de recherche original mené durant trois ans dans une équipe universitaire, dans un organisme de recherche ou dans une entreprise.

 DOMAINE
Toutes les formations du LMD sont regroupées en domaines. Les domaines de formation sont déterminés par chaque université en fonction de ses propres spécificités et de ses pôles d'excellences. Ils restent soumis à l'accord du Ministère. Un domaine regroupe plusieurs disciplines. Voici les 4 grands domaines de formation de l'UCO :
- Théologie et sciences religieuses
- Culture et langues.
- Sciences humaines, sociales et gestion.
- Sciences et technologies.

 MENTION
Subdivision du domaine. La mention peut elle-même se décliner en spécialités.

 SPÉCIALITÉ
Subdivision de la mention. En licence, seules les mentions LLCE (Langues, littératures et civilisation étrangères) et Sciences du sport se déclinent en spécialités.

 PARCOURS
Le parcours est une progression, au sein d'un ensemble cohérent de matières, adaptée au projet personnel et professionnel de l'étudiant. Grâce à une organisation pédagogique qui offre des enseignements obligatoires et des enseignements au choix, l'étudiant construit son parcours, en accord avec l'équipe pédagogique, en vue d'une mention de diplôme donnée.

 CREDITS ECTS (Acronyme anglais du Système européen de transfert de crédits)
Le système de crédits offre une unité de validation lisible dans les pays de l'Espace Européen de l'Enseignement Supérieur. C'est en quelque sorte une "monnaie d'échange commune". Chaque UE validée donne lieu à l'obtention d'un certain nombre de crédits, sur la base de 30 crédits maximum par semestre (60 par an). La valeur en crédits attribuée à l'UE tient compte de la quantité de travail que l'étudiant doit fournir pour obtenir cette UE : volume d'enseignement suivi mais également travail personnel, temps d'examen... Les crédits acquis sont définitivement capitalisables. Ils sont transférables (sous réserve d'acceptation par l'équipe pédagogique) en France et en Europe, c'est-à-dire qu'ils permettent à l'étudiant de faire reconnaître le parcours déjà réalisé et de poursuivre son cursus dans un autre établissement sans recommencer l'intégralité du parcours.

 PASSERELLES
Possibilités de réorientation prévues par l'organisation des enseignements et permettant par exemple de changer de mention de diplôme en cours de cursus tout en conservant les acquis du parcours antérieur. Les passerelles peuvent être de droit ou soumises à conditions.

 CAPITALISATION
La capitalisation est la conservation (obligatoire) d'une année sur l'autre des unités d'enseignement acquises (moyenne égale ou supérieure à 10/20). La capitalisation d'une unité d'enseignement entraîne celle des crédits correspondants.

 COMPENSATION
La compensation est la possibilité de valider une entité (unité d'enseignement, semestre, année) en obtenant une note égale ou supérieure à 10/20). La capitalisation d'une unité d'enseignement entraîne celle des crédits correspondants.